Lena (Emma Watson) y Daniel (Daniel Brühl) es una joven pareja que se ve envuelta en el golpe de Estado de Chile de 1973. Daniel es secuestrado por la policía secreta de Pinochet (Marcelo Vilaro), y Lena da con él en el sur del país, en una zona llamada Colonia Dignidad. Se dice que la Colonia es una misión de caridad llevada a cabo por un sacerdote, Paul Schäfer (Michael Nyqvist), pero en realidad, es un lugar del que nadie ha escapado nunca. Lena decide unirse al culto para encontrar a Daniel.